现代化组织病理学分析:用于肠道微殖民地生存试验的数字图像分析的全自动化工作流程

科学领域:

• 生物医学工程 生物医学工程
• 辐射瘤学 辐射瘤学
• 数字病理学数字病理学

背景情况:

• 手动组织病理图像分析是耗时的,容易产生主观错误.
• 量化辐射造成的胃肠道损伤需要准确地列举状密室.

研究的目的:

• 开发一个全自动化工作流程 (AW) 用于在微殖民地生存试验中计数阴茎密室.
• 以提高精度和效率量化辐射对胃肠道损伤的量化.

主要方法:

• 开发了一个自动化工作流程 (AW),利用基于深度学习的语义图像细分来进行密码检测.
• 实现了一个定制的加密计算算法和一个图形用户界面 (GUI) 用户审查.
• 处理了被辐射的小鼠骨切片的图像,包括剪切,正常化和密室计数.

主要成果:

• 该AW的准确度与训练有素的专家相美,计数偏差为 (10±8) %.
• 手动计数显示了观察者之间的显著变化 ((34 ± 26%),在经验丰富的计数器中减少到 (11 ± 6).
• AW在几个小时内处理了大量数据集 (540张图像),用户的精力最小.

结论:

• 自动化工作流程 (AW) 提供了快速,准确和可重现的胃肠道损伤量化.
• AW消除了手动分析固有的主观观察者间变化和人为错误.
• 开发的系统可以为辐射研究和临床应用提供高效的数字图像分析.