Runx3,Brn3a和Isl1的相互作用在自感神经元发育的早期阶段协调了转录程序
Kira Orlovsky1, Elena Appel1, Shay Hantisteanu1
1Department of Molecular Genetics, Weizmann Institute of Science, Rehovot, Israel.
Runx3转录因子通过与Brn3a和Isl1.1相互作用来调节TrkC神经元的发育. 这项研究解读了它们在通过发育神经元中的染色质可访问性来控制基因表达方面的合作.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 发展生物学 发展生物学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 在背部根 (DRG) 中,感官自感神经元的发育依赖于转录因子 (TF) Runx3.
- 由于TrkC神经元死亡,Runx3缺乏导致四肢缩.
- Pou4f1 (Brn3a) 和Isl1是感官神经元发育的额外关键TF.
研究的目的:
- 为了研究早期发育的TrkC神经元的染色质状态.
- 为了识别Runx3的高可信度目标基因 (HCT).
- 探索Runx3,Brn3a和Isl1在基因调节中的合作作用.
主要方法:
- RNA测序 (RNA-seq) 用于分析Runx3-异合体与同合体TrkC神经元中的差异基因表达.
- CUT&RUN测定用于绘制Runx3,Brn3a,Isl1和H3K27Ac的全基因组占用率.
- ATAC-seq以评估可转移元素-可访问色素的景观.
主要成果:
- 通过交叉基因组占用和差异表达数据,确定了244个Runx3高置信性点基因 (HCT).
- Brn3a和Isl1结合于许多位点,其中一些重叠的Runx3结合位点,主要是在远端增强剂中.
- Runx3主要通过远端增强剂与Brn3a合作进行神经元基因调节,而Runx3单独抑制免疫基因.
结论:
- 在调节Runx3 HCT中阐明了Runx3,Brn3a,Isl1和开放色素区域之间的相互作用.
- 突出了Runx3在TrkC神经元发育中的独特作用及其与其他TF的合作.
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