用单一的自动化蛋白质原子工作流来分析各种生物流体,以发现生物标志物

科学领域:

• 蛋白质组学是指蛋白质组学.
• 生物标志物发现发现
• 临床质谱测量 临床质谱测量

背景情况:

• 在生物流体中发现蛋白质生物标志物对于理解人类疾病至关重要.
• 近年来,技术进步改善了蛋白质组覆盖率和样本吞吐量.
• 虽然血液是常见的,但其他液体如脑脊液,尿液和牛奶为特定病理提供了独特的见解.

研究的目的:

• 适应和验证可扩展的自动化蛋白质组管道 (ASAP2) 对各种生物流体样本.
• 证明工作流程的适用性超出血液和CSF,包括牛奶和尿液.
• 为了保持大规模的临床蛋白质组研究的高通量和稳定性.

主要方法:

• 对牛奶 (脱脂) 和尿液 (乙沉) 样本的ASAP2工作流程的调整.
• 自动化样品制备,包括减少,化,消化和标签 (异).
• 液体染色学-质谱学 (LC-MS) 分析和随后的数据处理.

主要成果:

• ASAP2的工作流已成功修改为牛奶和尿液样本的准备.
• 关键的自动化步骤 (减少,化,消化,标记,聚合,净化) 在生物流体中是一致的.
• 该管道支持高通量分析,这对于临床研究中生物标志物发现至关重要.

结论:

• 适应的ASAP2工作流提供了一个强大的和可扩展的解决方案,用于对各种人类生物流体的蛋白质组分析.
• 这种标准化的方法可以在各种样本类型中进行大规模的蛋白质生物标志物发现.
• 该方法支持对基于LC-MS的临床研究进行有效的样本准备.