在妊娠晚期猪胎盘和子宫内膜的RNA-seq数据

科学领域:

• 生殖生物学 生殖生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 动物科学动物科学

背景情况:

• 小猪的周产死亡率是一个重大问题,通常与妊娠结束时胎儿成熟度不足有关.
• 最佳的胎儿发育依赖于在胎儿与母亲的界面上平衡的营养交换.

研究的目的:

• 调查小猪胎母接口的转录组,以了解影响胎儿成熟和生存的因素.
• 为了确定关键的基因和途径,涉及到母体和胎儿之间的对话在晚期怀孕期间.

主要方法:

• RNA测序 (RNA-seq) 在来自不同新生儿死亡率的大白猪和Meishan猪品种的子宫内膜和胎盘组织上进行.
• 转录组数据使用Nextflow nf-core/rnaseq和TAGADA管道进行转录和lncRNA量化处理.
• 分析包括来自PORCINET组织收集的224个子宫内膜和224个胎盘样本.

主要成果:

• 在怀孕晚期产生的胎儿 - 母亲界面的综合转录概况被生成.
• 基因表达数据为进一步分析提供了基础,包括差异表达和丰富分析.
• 该研究记录了纯种和杂种胎儿的转录组,考虑母猪品种,妊娠日,性别和胎儿成熟度.

结论:

• 生成的转录基因数据集为对胎儿成熟的胎儿与母亲相互作用提供了宝贵的见解.
• 这项研究是通过改进管理和育种策略来了解和潜在地减轻小猪围产死亡率的起点.