计算工具的全面基准测试,用于预测化学品的毒动力学和物理化学性质
Domenico Gadaleta1, Eva Serrano-Candelas2, Rita Ortega-Vallbona2
1Laboratory of Environmental Chemistry and Toxicology, Department of Environmental Health Sciences, Istituto di Ricerche Farmacologiche Mario Negri IRCCS, Milan, Italy. domenico.gadaleta@marionegri.it.
本研究评估了用于预测化学安全性质的计算工具. 许多定量结构-活性关系 (QSAR) 模型在物理化学和毒性动力学特性方面表现良好,有助于化学安全评估.
科学领域:
- 计算毒理学计算毒理学
- 环境化学环境化学
- 化学信息学 化学信息学
背景情况:
- 化学安全评估依赖于物理化学 (PC) 和毒动力学 (TK) 特性.
- 计算方法越来越多地用于减少实验测试,特别是动物使用.
- 定量结构-活动关系 (QSAR) 模型是预测这些属性的关键工具.
研究的目的:
- 评估12个软件工具的预测性能,对17个PC和TC属性实施QSAR模型.
- 确定强大的计算工具,用于高通量化学性质评估.
- 为研究人员,监管机构和行业提供指导.
主要方法:
- 选择了12个具有QSAR模型的软件工具.
- 从文献中收集和策划了41个外部验证数据集.
- 在适用性领域内评估外部可预测性和性能.
- 分析了验证数据集的化学空间覆盖范围.
主要成果:
- 大多数评估的QSAR工具都显示出足够的预测性能.
- 对于PC属性的模型 (平均R2=0.717) 的表现优于TK属性模型 (平均R2=0.639,平衡精度=0.780).
- 几种工具在各种属性中显示出一致的良好预测性,并被确定为最佳选择.
结论:
- 这项研究证实了QSAR模型在预测基本化学性质方面的有用性.
- 推的最佳性能模型为高通量选提供了强大的解决方案.
- 结果支持对化学安全和设计的计算工具进行知情选择.
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