海产真菌生物活性天然产品的基因组挖掘和生物合成途径
Caihua Han1, Anjing Song1, Yueying He1
1School of Bioengineering, Zunyi Medical University, Zhuhai, China.
Frontiers in microbiology
|December 27, 2024
概括
海洋真菌从无声的生物合成基因集群 (BGCs) 产生有价值的药物. 这篇评论探讨了基因组挖掘和途径阐明方法,以解锁这些化合物用于药物发现.
科学领域:
- 海洋生物学 海洋生物学
- 自然产品化学 自然产品化学
- 药理学 药理学是指药理学的学科.
背景情况:
- 海洋真菌天然产品 (MFNP) 是制药发展的关键资源.
- 许多MFNP是由生物合成基因集群 (BGC) 合成的,在标准实验室条件下通常是无声的,阻碍了药物发现.
- 克服BGC沉默是获得新型海洋制药的关键.
研究的目的:
- 审查MFNP的基因组挖掘的最新进展.
- 突出阐明MFNP生物合成途径和酶功能的方法.
- 为未来的海洋真菌BGCs基因导向采矿提供见解.
主要方法:
- 生物信息学分析用于识别BGCs.
- 基因淘汰技术用于研究BCC功能.
- 异质表达激活和研究沉默的BGCs.
- 比较基因组学和转录基因组学.
主要成果:
- 识别了许多MFNP及其相应的BGC.
- 阐明关键MFNP的生物合成途径和酶机制.
- 使用各种策略成功激活无声BGC的演示.
- 参与MFNP生物合成的新型酶的表征.
结论:
- 基因组挖掘和途径阐明对于释放MFNP的制药潜力至关重要.
- 像生物信息学,基因淘汰和异质表达等先进技术对于克服BGC沉默至关重要.
- 这一综述为未来在海洋真菌天然产品发现和药物开发方面的研究提供了基础.
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