使用来自加利福尼亚州县的多个下水道的废水数据来估计SARS-CoV-2的有效繁殖数量
Sindhu Ravuri1, Elisabeth Burnor1, Isobel Routledge1
1California Department of Public Health Center for Infectious Diseases, 850 Marina Bay Parkway, Richmond, CA 94804, United States.
Epidemics
|December 27, 2024
概括
废水监测为跟踪SARS-CoV-2传播提供了一种可靠的,互补的方法,为有效繁殖数提供准确的估计,与基于病例的数据可比. 这种方法增强了公共卫生监测能力.
科学领域:
- 流行病学和公共卫生监测监测
- 环境病毒学 环境病毒学
- 传染病建模传染病建模
背景情况:
- 传统的SARS-CoV-2监测依赖于病例数据,这种数据可以通过测试可用性和行为来限制.
- 废水监测为监测传染病提供了人口层面的,公正的数据流.
- 有效繁殖数 (Rt) 是了解疾病传播动态的关键指标.
研究的目的:
- 为了估计县汇总的,下水道限制废水的SARS-CoV-2有效繁殖数量.
- 为了比较两种基于废水的模型与传统的基于案例的估计的性能.
- 评估废水监测作为公共卫生补充工具的有用性.
主要方法:
- 从2022年5月到2023年4月使用平滑和脱废水SARS-CoV-2度估计的县级有效繁殖数量.
- 在废水数据分析中采用了两种不同的建模方法.
- 使用MAE,斯皮尔曼相关性,混矩阵和交叉相关性分析,与基于案例的数据对比验证的废水估计.
主要成果:
- 基于废水的有效繁殖数模型与基于案例的估计结果具有很高的一致性 (MAE ≤0.09, ρ ≥0.66,精度 ≥0.81).
- 交叉相关性分析揭示了废水和病例数据之间在各种时间滞后的强烈关联.
- 开发的方法是可通用的,强大的,并可用于公共卫生监测.
结论:
- 基于废水的现时测量为传统的SARS-CoV-2病例监测提供了可靠的补充.
- 这种方法可以为地方和州级的公共卫生决策提供实时信息.
- 基于公开可用的废水的现在排放量是为了加利福尼亚传染病评估工具而生成的.
