不同的微生物,代谢物和宿主基因组定义了右侧和左侧结肠癌中的多omics配置文件

科学领域:

• 胃肠病学 胃肠病学
• 在瘤学瘤学.
• 微生物组研究 微生物组研究

背景情况:

• 右侧结肠癌 (RCC) 和左侧结肠癌 (LCC) 之间存在临床异质性.
• 之前的研究缺乏多项分析 (遗传学,微生物群,代谢物) 来解释特定地点的差异.

研究的目的:

• 通过多omics方法调查结肠癌的特定部位差异.
• 确定与RCC和LCC相关的独特的微生物,代谢和基因组特征.

主要方法:

• 在16S rRNA基因测序和多omics队列中分析了494名参与者.
• 利用了元基因组测序,代谢学,全外体测序 (WES) 和转录组测序 (RNA-seq).
• 与瘤位置相关的肠道细菌,代谢物和宿主基因表达模式.

主要成果:

• 确定了不同的微生物 (例如,RCC中的Flavonifractor plautii,Bacteroides sp. 在LCC中A1C1),代谢 (例如,RCC中的L-phenylalanine,L-citrulline在LCC中) 和基因组 (例如,RCC中的PHLDA1,LCC中的TCF25) RCC和LCC的个人资料.
• 在RCC中发现F. plautii与L-phenylalanine积累和WBP1抑制有关.
• 在LCC中与D-ornithine/L-citrulline积累和TCF25/HLA-DRB5激活相关的B.A1C1.

结论:

• 在右侧与左侧结肠癌中建立了肠道微生物群,代谢物和宿主基因组之间的新联系.
• 表明在结直肠癌 (CRC) 治疗中有可能针对肠道微生物群与宿主相互作用.