通过整合功能分析和生物信息学重新分类一种新的POMT1变体:对植入前遗传测试的含义
Binyu Ma1,2,3, Zhidan Hong1,2,3, Li Zhang4
1Center for Reproductive Medicine, Zhongnan Hospital of Wuhan University, Wuhan, Hubei, P.R. China.
Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
|December 31, 2024
概括
全外体测序 (WES) 有助于识别与胎儿形相关的致病性POMT1变异. 结合生物信息学和体外研究,重新分类了一种不确定的意义 (VUS) 的变异,使得成功的单一性疾病 (PGT-M) 的植入前遗传测试成为可能.
科学领域:
- 遗传学和基因组学 遗传学和基因组学
- 生殖医学 生殖医学
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 整体外体序列 (WES) 越来越多地用于遗传查,但解释意义不明的变异 (VUS) 给遗传咨询带来了挑战.
- 针对单一性疾病的植入前遗传检测 (PGT-M) 对于预防遗传性疾病的传播至关重要.
- 经常出现的胎儿形可能表明潜在的遗传原因需要精确的诊断.
研究的目的:
- 通过WES在一个家庭中研究复发性胎儿形的遗传基础.
- 通过综合生物信息学和体外分析,重新分类POMT1基因的不确定的意义 (VUS) 变异.
- 为了证明准确的变种分类对成功的PGT-M的有用性.
主要方法:
- 在试验对象上进行了全外体测序 (WES).
- 生物信息学分析被用来评估已识别的POMT1变异对蛋白质结构和功能的影响.
- 使用HEK293T细胞进行了体外研究,以评估POMT1mRNA,蛋白质积累,细胞活力和局部化的c.1483G>A变异的功能后果.
主要成果:
- 在试验中,WES确定了复合异性POMT1变体 (c.1052+1G>A和c.1483G>A),c.1483G>A最初被归类为VUS.
- 生物信息学和体外实验表明,c.1483G>A变种破坏了POMT1的酶活性,蛋白质积累,细胞活力和局部化,导致其被重新分类为可能致病性.
- 精确的分类使这对夫妇能够成功地使用PGT-M,从而生下了一个健康的孩子.
结论:
- 综合生物信息学和体外功能研究对于重新分类VUS和提供准确的遗传诊断至关重要.
- 这项研究扩大了与胎儿形相关的POMT1变异的已知谱.
- 这些发现支持基因测试和精确的变异解释在指导PGT-M决策的关键作用,对于有复发性胎儿异常的家庭.
