FB5P-seq-mAbs:从FB5P-seq库中产生单克隆抗体,用于B细胞的整合单细胞分析

科学领域:

• 免疫学 免疫学 免疫学
• 分子生物学分子生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 单个B细胞分析对于了解免疫反应至关重要.
• 从单独的序列中推断B细胞抗原受体的特异性和亲和力是具有挑战性的.
• 功能性检测需要从单个B细胞中克隆和表达抗体.

研究的目的:

• 开发一种用于单个B细胞分析的综合方法.
• 将B细胞转录组和抗原受体序列与功能性抗体特性联系起来.
• 为了使罕见的B细胞子集的特征.

主要方法:

• 开发了一种方法,将基于FACS的5端单细胞RNA测序 (FB5P-seq) 与单克隆抗体克隆相结合.
• 单个B细胞被分类为逆转录,cDNA条形码和放大.
• 从FB5P-seq库中检索了配对的BCR序列和全转录组基因表达.
• 已存档的cDNA被用于克隆重链和轻链可变区域,用于抗体生产和功能测试.

主要成果:

• 成功地将该方法应用于卵胺特异性小鼠生殖中心B细胞.
• 证明了检索转录组全方位基因表达和配对BCR序列的能力.
• 能够生产和净化用于功能分析的单克隆抗体.
• 验证了综合方法的稳定性,灵活性和成本效益.

结论:

• 集成的FB5P-seq和抗体克隆方法为单个B细胞分析提供了强大的工具.
• 这种方法可以映射B细胞子集的抗原特异性和亲和力.
• 它适用于不同的B细胞类型和物种,促进了免疫反应研究.