在接受HIGK治疗的F.I.中失调的基因. 核和它们与HNSCCCC的可能关联
S B Shanmugam1,2, J Vijayashree Priyadharsini1, P Anitha1
1Clinical Genetics Lab, Centre for Cellular and Molecular Research, Saveetha Dental College & Hospital, Saveetha Institute of Medical and Technical Sciences [SIMATS], Saveetha University, Chennai, India.
杆菌核菌感染与头部和部状细胞癌 (HNSCC) 有关. 基因ZNF426在HNSCC中表达变化,并影响患者的存活率,这表明它是潜在的治疗标.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 在瘤学瘤学.
- 微生物学 微生物学
背景情况:
- 头部和部状细胞癌 (HNSCC) 是一个重要的全球健康问题.
- 越来越多地认识到特定的微生物感染,如Fusobacterium nucleatum (Fn) 在HNSCC发展中的作用.
- 鉴定受微生物暴露影响的宿主遗传因素对于理解HNSCC病变发生至关重要.
研究的目的:
- 在Fusobacterium nucleatum (Fn) 治疗后,在HIGK细胞中识别差异表达的基因.
- 研究这些基因在头部和部状细胞癌 (HNSCC) 的发展中的潜在作用.
- 为了确定与Fn感染相关的HNSCC的潜在诊断或预后生物标志物.
主要方法:
- 使用了分析公共数据集的计算方法 (GEOmnibus GSE6927,TCGA HNSCC).
- 进行了GEO2R分析,以确定Fn处理的HIGK细胞中差异表达的基因.
- 使用UALCAN数据库分析HNSCC患者数据中的基因表达特征.
主要成果:
- 在Fn处理的HIGK细胞中鉴定了22个差异表达的基因.
- 在Fn处理的HIGK细胞和HNSCC数据集中发现了五个具有保存表达模式的基因 (GSDMD,NUP214,ZNF426,FUT2,SERPINB2).
- 观察到ZNF426表达与HNSCC患者的存活率有显著的相关性,较低的表达与更差的预后相关.
结论:
- ZNF426被确定为一个候选基因,涉及到Fusobacterium nucleatum感染和HNSCC的发展.
- 改变ZNF426的表达可以作为HNSCC患者的预后生物标志物.
- 针对ZNF426的表观遗传修饰的进一步验证和调查可能为HNSCC提供潜在的治疗策略.
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