在乳腺癌患者中使用代谢面板发现生物标志物和开发预后预测模型:一种混合方法,集成机器学习和可解释的人工智能
Fatma Hilal Yagin1, Yasin Gormez2, Fahaid Al-Hashem3
1Department of Biostatistics and Medical Informatics, Faculty of Medicine, Inonu University, Malatya, Türkiye.
Frontiers in molecular biosciences
|January 2, 2025
概括
这项研究使用向代谢学和可解释的人工智能 (XAI) 识别了新的乳腺癌 (BC) 生物标志物. 这些发现突出了特定的氨基酸作为改善BC检测和预后的关键指标.
科学领域:
- 代谢学 代谢学 代谢学
- 生物标志物发现发现
- 在瘤学中使用人工智能
背景情况:
- 乳腺癌 (BC) 仍然是妇女死亡的主要原因.
- 代谢在BC病变发生过程中起着至关重要的作用,但需要强大的生物标志物来检测和预后.
- 有针对性的代谢组学与先进的分析相结合,为改善BC诊断提供了潜力.
研究的目的:
- 为了确定乳腺癌 (BC) 检测的向代谢生物标志物候选者.
- 使用可解释的人工智能 (XAI) 开发和验证BC的预测模型.
- 增强在BC管理中的代谢学药物的临床实用性.
主要方法:
- 来自102名BC患者和99名健康对照者的血样本接受了有针对性的代谢学分析.
- 开发了机器学习 (ML) 模型,并应用了特征选择方法.
- 谢普利添加式扩展 (SHAP) 是一种XAI技术,用于解释最佳BC预测模型.
主要成果:
- 变量选择增强了用于BC分类的ML模型性能.
- 最佳模型使用了基于SVM-SHAP的特征选择的逻辑回归.
- 发现的关键潜在的BC生物标志物包括氨酸,氨酸,L-氨酸,氨酸和荷马氨酸.
- 组合的代谢物标记物获得了高分类性能:精度为89.50%,回忆率为88.38%,特异性为83.67%.
结论:
- 这项研究有助于发现新的乳腺癌 (BC) 生物标志物.
- 通过XAI解释的向代谢学显示出了促进BC诊断的巨大潜力.
- 鉴定的生物标志物和模型可以帮助早期检测和管理BC.
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