跨多个Mycobacterium abscessus分离体的转子子体测序揭示了菌株之间显著的功能基因组多样性

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 传染性疾病 传染性疾病

背景情况:

• 菌根杆菌 (Mab) 是一个重要的病原体,导致难以治疗的感染.
• 由于其大型辅助基因组,Mab的遗传多样性是相当大的.
• 以前的功能基因组研究仅限于参考菌株,阻碍了对临床隔离变异的理解.

研究的目的:

• 在21种基因多样化的Mycobacterium abscessus临床分离物中调查功能性基因组多样性.
• 识别不同Mab菌株,亚种和血统的基本基因和非基本基因.
• 了解遗传多样性如何影响基因本质性,并确定潜在的药物标.

主要方法:

• 对21个M.的临床分离体 (15个亚种) 进行了转体子序列测定 (TnSeq). , 6 个亚种. 马斯里兰塞斯 (massiliense).
• 进行了泛基因组分析,以确定核心和辅助基因.
• 基因关键性概况在隔离物中进行分析,以识别差异性要求的基因和遗传网络.

主要成果:

• 确定了3845个基因的核心基因组和11507个基因的辅助基因组.
• 259个核心必需基因和425个差异性要求的基因 (约. 10%的核心基因组) 在隔离物中被确定.
• 发现了具有亚种,血统和分离特异性的基因,以及19个新的遗传网络.

结论:

• Mycobacterium abscessus的临床分离体表现出显著的功能多样性,反映出它们的遗传多样性.
• 了解这种功能变异对于破译Mab的生物学和临床表型至关重要.
• 这些发现为开发针对各种Mab感染的向治疗提供了基础.