使用双标记器 (MADM) 的马赛克分析,在转录层面探测突变表型的细胞类型特异性
Giselle Cheung1, Florian M Pauler1, Simon Hippenmeyer2
1Institute of Science and Technology Austria (ISTA), Klosterneuburg, Austria.
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
|January 2, 2025
概括
使用双标记器的马赛克分析 (MADM) 允许研究人员研究单个细胞中的基因功能. 这种方法将遗传标记与单细胞测序相结合,以分析突变对细胞发育的影响.
科学领域:
- 发育生物学是发展生物学.
- 遗传学 是一个遗传学.
- 神经科学是一个神经科学.
背景情况:
- 双标记的马赛克分析 (MADM) 是一种强大的小鼠遗传技术.
- MADM使分裂细胞及其后代的差异光标记和基因操纵成为可能.
- 它允许可视化单个控制或在异构细胞背景中的同胞性突变细胞.
研究的目的:
- 描述一种将MADM与单细胞RNA测序相结合的协议.
- 为了实现由遗传突变引起的细胞类型特定表型的高分辨率分析.
- 研究细胞在发育过程中的自主基因功能.
主要方法:
- 产生和隔离MADM标记细胞.
- 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 技术的应用.
- 将基因操纵与单细胞水平的转录基因分析相结合.
主要成果:
- 描述的协议有助于研究复杂组织中的单个细胞.
- 它允许精确分析因基因突变而发生的转录组变化.
- 与scRNA-seq结合的MADM为发育研究提供了前所未有的细胞分辨率.
结论:
- 这种综合方法增强了对细胞发育中的基因功能的理解.
- 它为解剖神经科学及其他领域的细胞自主机制提供了一个强大的工具.
- 该协议对于在单细胞分辨率下探测基因型-表型关系是有价值的.
