卡林:鼠标线用于同时读取血统历史和基因表达

科学领域:

• 发展生物学 发展生物学
• 遗传学 是一个遗传学.
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 细胞谱系追踪对于理解发育和疾病至关重要.
• 现有的方法往往缺乏动态研究的分辨率或灵活性.
• 激活CRISPR的修复谱系追踪 (CARLIN) 鼠标谱系是为了解决这些局限性而开发的.

研究的目的:

• 详细说明维护和使用CARLIN鼠标系列的协议.
• 为了实现高分辨率的,可诱导的细胞系追踪 in vivo.
• 为了方便从单细胞中同时查询血统和基因表达.

主要方法:

• 维护卡林老鼠殖民地.
• 使用CRISPR技术的诱导条形码策略.
• 来自DNA,RNA和scRNA-seq库的CARLIN条形码的扩展.
• 下一代测序用于条形码分析.

主要成果:

• 卡林系统允许精确,时间控制的血统标签.
• 从单个细胞同时捕获血统和基因表达数据.
• 针对不同样本类型的强大的条形码放大协议.

结论:

• 卡林鼠标系列为高分辨率的体内血统追踪提供了强大的工具.
• 这种可诱导系统增强了在整个发育和成年期研究细胞动态的灵活性.
• 详细的协议促进了CARLIN在发育生物学及其他领域的各种研究问题上的应用.