亚特拉斯-seq:一个微流体单细胞TCR屏幕,用于抗原反应型TCR

科学领域:

• 免疫学 免疫学 免疫学
• 分子生物学分子生物学
• 生物技术是生物技术.

背景情况:

• 发现抗原反应性T细胞受体 (TCR) 对于开发有效的工程T细胞免疫疗法至关重要.
• 传统的方法,如MHC多重染色,优先考虑高亲和度的TCR,可能会错过那些具有优异T细胞激活功效的TCR.

研究的目的:

• 开发和验证ATLAS-seq,一种微流体单细胞查技术,用于根据功能活动识别抗原反应性T细胞.
• 将ATLAS-seq识别的TCR与使用MHC多重染色发现的TCR的疗效进行比较.

主要方法:

• 开发了ATLAS-seq,这是一种微流体方法,使用基于体的传感器在抗原刺激时检测单个T细胞的IFNγ分泌物.
• 集成的单细胞RNA和TCR测序与ATLAS-seq平台.
• 从外围血液单核细胞 (PBMCs) 选的对细胞巨乳病毒 (CMV) 和前列腺特异抗原 (PSA) 反应的TCRs.

主要成果:

• 亚特拉斯-seq成功分离和特征激活的T细胞.
• 鉴定出不同的TCR克隆类型,与通过MHC多重染色获得的T细胞激活水平相比,其激活水平显著更高.
• 通过ATLAS-seq识别的TCRs在杀死细胞方面表现出增强的疗效.

结论:

• ATLAS-seq为查抗原反应型TCR提供了一个高效和多功能平台.
• 这项技术可以识别具有卓越功能活性的TCR,以推进工程T细胞免疫疗法.
• ATLAS-seq克服了基于亲和力的TCR发现方法的局限性.