发现天然产品作为SARS-CoV-2尖端蛋白的潜在抑制剂

科学领域:

• 生物化学 生物化学
• 计算生物学 计算生物学
• 药理学 药理学是指药理学的学科.

背景情况:

• 在SARS-CoV-2的流行病需要新的治疗策略.
• 自然产品 (NPs) 为药物发现提供了一个有前途的途径.
• 抑制尖端 (S) 蛋白进入宿主细胞是一个关键的治疗点.

研究的目的:

• 识别有潜力抑制SARS-CoV-2 S蛋白进入的天然产品.
• 通过计算来选二次代谢物 (SMs) 的药物相似性和结合亲和力.
• 发现针对SARS-CoV-2的新型治疗候选药物.

主要方法:

• 从日本蛋白质数据库 (PDBJ) 和BindingDB.收集的S-糖蛋白序列.
• 在S-糖蛋白序列上进行了聚类分析.
• 确定了结合分子 (BM),并将它们与KNApSAcK的二次代谢产物 (SM) 进行了比较.
• 进行了分子对接和药物相似性分析 (利宾斯基规则,生物可用性雷达,生物可用性得分).

主要成果:

• 确定了204个S-糖蛋白序列和33722个结合分子.
• 与KNApSAcK.的52,107种二次代谢产物进行了BMs比较.
• 根据结合能量,药物相似性和生物可用性,预测了14种SM作为潜在的抑制剂.
• 这些14种SM显示出抑制主要S蛋白类型的有利特性.

结论:

• 计算分析确定了14种天然化合物作为SARS-CoV-2 S蛋白进入的潜在抑制剂.
• 这些化合物表现出有利的药物相似性和结合性.
• 这项研究为实验验证这些天然产品作为抗SARS-CoV-2疗法奠定了基础.