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Updated: Jun 4, 2025
06:16
mirMachine: A One-Stop Shop for Plant miRNA Annotation
Published on: May 1, 2021
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类动物中的miRNA-target互补性类似于植物中的对应性
Yael Admoni1, Arie Fridrich2, Paris K Weavers3
1Department of Ecology, Evolution and Behavior, Alexander Silberman Institute of Life Sciences, Faculty of Science, Hebrew University of Jerusalem, Jerusalem, 9190401, Israel. yael.admoni@mail.huji.ac.il.
EMBO reports
|January 3, 2025
概括
类微RNAs (miRNAs) 主要像植物的miRNAs一样起作用,需要广泛的互补性来实现基因沉默. 双边类似的基于种子的调节在类动物中是无效的,这表明植物和动物类miRNA机制的古代进化起源.
科学领域:
- 发展生物学 发展生物学
- 分子生物学分子生物学
- 进化生物学 进化生物学
背景情况:
- 微RNAs (miRNAs) 是控制基因表达的关键转录后调节者.
- 动物miRNA通常使用种子序列进行翻译抑制,而植物miRNA则依赖于mRNA裂变的几乎完全互补性.
- 最近发现,Cnidarian miRNAs在其机制上类似于植物miRNAs,但基于种子的调节潜力仍然不清楚.
研究的目的:
- 为了调查miRNA活动的互补性要求在 cnidarian Nematostella vectensis.
- 为了确定双边类型的基于种子的miRNA向是否在 cnidarians 中是功能性的.
- 为了比较miRNA-target的交互作用,在cnidarians和其他metazoans.
主要方法:
- 在Nematostella vectensis中对miRNA-目标互补性的实验操纵.
- 基于结合部位特征的miRNA介导基因淘汰效率的评估.
- 在Nematostella,Hydractinia和斑马鱼中对miRNA沉默机制的比较分析.
主要成果:
- 只有种子或种子和补充的3'互补性,典型的双边miRNAs,是不足以有效的miRNA介导敲击在Nematostella.
- 在miRNA-目标分离部位内的不匹配降低了基因沉默效率.
- 典型的双边miRNA向策略 (三个种子部位) 在斑马鱼中无效,但在尼马托斯特拉和水菌中具有功能.
结论:
- 昆类miRNAs与植物miRNAs具有功能上的相似性,强调了在目标识别和分离方面广泛的互补性.
- 在双边动物中常见的基于种子的调节机制在研究的类动物中不起作用.
- 这些发现支持植物和动物miRNA系统的潜在共同进化起源.
