一个协调NHS苏格兰实验室数据的管道,以便在国家一级进行分析
Chuang Gao1, Shahzad Mumtaz2, Sophie McCall3
1Health Informatics Centre, School of Medicine, University of Dundee, UK; Population Health and Genomics, School of Medicine, University of Dundee, UK.
Journal of biomedical informatics
|January 4, 2025
概括
研究人员现在可以访问苏格兰各地的协调实验室数据. 一个开源软件管道解决了数据异质性,使用电子健康记录实现了高效的,国家一级的健康研究.
科学领域:
- 医疗信息学 医疗信息学
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 电子健康记录 (EHR) 对于数据驱动的健康研究至关重要.
- 苏格兰的医学实验室数据显示,当地卫生局之间存在显著的异质性.
- 现有的国家数据集 (住院治疗,处方,死亡登记) 缺乏标准化的实验室数据.
研究的目的:
- 开发一个开源软件管道,用于协调苏格兰的区域实验室数据.
- 为研究目的创建一个统一的,国家一级的实验室数据集.
- 为了减少与不同区域实验室数据集工作的研究人员所需的时间和精力.
主要方法:
- 从苏格兰的四个区域安全港获得的样本实验室数据.
- 比较变量并将它们映射到11个FHIR和2个苏格兰特有的标准化术语.
- 开发数据转换以标准化单位,并使用阅读代码和SNOMED CT进行测试编码.
主要成果:
- 确定了180个关键测试代码,占苏格兰所有实验室测试的98.7%.
- 成功开发转换以标准化测试结果单位.
- 该管道有效地使用阅读代码和SNOMED CT.进行编码测试.
结论:
- 验证了苏格兰实验室数据的协调管道.
- 该管道有助于在国家一级生成清洁,协调的实验室数据.
- 这种开源解决方案可以很容易地被研究人员和安全港所采用,以提高数据的可访问性和可用性.


