在赞比亚的猪群中首次发现并对轮状病毒C的全基因组进行了鉴定和鉴定
Hayato Harima1, Yongjin Qiu2, Michihito Sasaki3
1Laboratory of Veterinary Public Health, Faculty of Agriculture, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo, 183-8509, Japan.
Virology
|January 5, 2025
概括
罗塔病毒C (RVC) 感染小猪,导致胃肠炎. 这项研究确定了赞比亚猪的RVC,揭示了两种新型菌株和在样本人群中53.1%的高流行率.
科学领域:
- 兽医病毒学 兽医病毒学
- 分子流行病学分子流行病学
背景情况:
- 罗塔病毒C (RVC) 是新生猪中急性胃肠炎的重要原因.
- 非洲猪种群中RVC的分布和流行程度在很大程度上是未知的,这阻碍了有效的疾病管理.
研究的目的:
- 在赞比亚猪中识别和表征罗塔病毒C菌株.
- 为了确定RVC感染在赞比亚猪种群中的流行率.
主要方法:
- 甲基因组分析用于在猪便样本中识别RVC.
- 在已识别的RVC菌株上进行了全基因组测序.
- 使用RT-qPCR检查较大的猪便样本队列,以检测RVC存在.
主要成果:
- 两种不同的RVC菌株ZP18-77-c1和ZP18-77-c2从单个样本中被识别并完全测序.
- 遗传分析显示,已知的猪RVC菌株具有高核酸序列相同性 (87.7-94.5%).
- 检测到RVC感染的高患病率,53.1% (78/147) 的样本通过RT-qPCR检测呈阳性.
结论:
- 这项研究报告了非洲RVC菌株的第一个完整基因组序列.
- 在赞比亚的猪群中存在RVC感染的显著流行率.
- 这些发现凸显了对非洲RVC流行病学的进一步调查的需要.


