鱼流细胞测量揭示了微生物组广泛的变化后翻译修改和改变的微生物丰富性在儿童的炎症性肠道疾病
Mevlut Ulas1,2, Seamus Hussey1,2,3, Annemarie Broderick1,3
1Department of Paediatrics, University College Dublin, CHI-Crumlin, D12 N512 Dublin, Ireland.
Pathogens (Basel, Switzerland)
|January 8, 2025
概括
微生物氨酸酸化 (p-Tyr) 在患有炎症性肠病 (IBD) 的儿童中升高. 这项研究使用光在位杂交流细胞计 (FISH-FC) 来揭示细菌转化后修饰 (PTM) 中与炎症相关的变化.
科学领域:
- 微生物组研究的研究.
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 在炎症性肠病 (IBD) 中研究微生物组后翻译修饰 (PTM) 是具有挑战性的.
- 炎症对细菌PTM的影响,特别是小儿IBD中的铁酸化 (p-Tyr),在很大程度上是未知的.
- 现有的微生物组分析方法在评估PTM方面存在局限性.
研究的目的:
- 适应和优化光在现场杂交流细胞计 (FISH-FC) 进行微生物组范围的p-Tyr.研究.
- 研究患有IBD和没有IBD的儿童之间微生物p-Tyr水平的差异.
- 探索年龄,IBD状态,特定细菌群落和p-Tyr水平之间的关系.
主要方法:
- 适应和优化光在现场杂交流细胞计 (FISH-FC).
- 在便样本中量化微生物组范围的氨酸酸化 (p-Tyr).
- 对包括*Faecalibacterium prausnitzii*, *Bacteroidota*, *Gammaproteobacteria*和 *Bifidobacteria*在内的关键群体的细菌丰富性的分析.
主要成果:
- 微生物p-Tyr信号在IBD儿童中明显高于健康对照组.
- 虽然某些细菌群体表现出丰富的差异,但在IBD和非IBD群体之间,它们中的p-Tyr变异很小.
- 在健康儿童中,p-Tyr随着年龄的增长而下降,而在IBD患者中,p-Tyr随着年龄的增长而增加.
- 9岁以上的健康儿童的p-Tyr水平比9岁以下的儿童低.
结论:
- 在小儿IBD中,全微生物组的p-Tyr升高,健康儿童和IBD儿童之间因年龄而异.
- 炎症对细菌p-Tyr的影响是社区特有的.
- FISH-FC是一种可行的方法来研究微生物群PTM景观.
