一个全基因组扫描非编码RNA和增强器的折射误差和近视

科学领域:

• 遗传学和眼科 医学
• 非编码RNA和基因调控法规
• 复杂的特征遗传学复杂的特征遗传学

背景情况:

• 折射误差 (RE) 和近视是复杂的多基因疾病,许多相关的遗传变异位于非外标区域.
• 这些疾病的儿童发病表明基因调节在它们的发病过程中起着重要作用.
• 传统的基因寻找方法可能无法完全捕捉RE和近视的遗传结构.

研究的目的:

• 调查非编码RNA (微RNA和长非编码RNA) 和增强剂与折射误差和近视之间的变异之间的关联.
• 探索这些相关变异对眼部生物识别测量和使用遗传风险得分的进展的联合影响.
• 为了确定候选的非编码元素,以在近视的背景下为未来的功能验证.

主要方法:

• 使用公开数据库 (miRNASNPv2,PolymiRTS,VISTA增强浏览器,FANTOM5, lncRNASNP2) 的单核酸多态 (SNP) 的遗传关联研究.
• 利用一个大型全基因组关联研究 (GWAS) 的元分析 (N=160,420) 进行RE和近视关联.
• 计算了增强剂,lncRNAs和microRNAs (miRNAs) 的遗传风险得分 (GRSs),并在一个独立的儿童队列中测试了它们与眼部生物识别的关联 (R世代研究,N=3638).

主要成果:

• 增强剂,lncRNA基因和miRNA结合位点中的SNP在RE和近视相关的位置内被发现.
• 来自增强剂的GRS与折射误差,轴长/角膜半径和轴长进展显著相关.
• 来自lncRNA的GRS与轴长/角膜半径和轴长进展有显著的关联;与miRNA相关的GRS没有显著的关联.

结论:

• 增强剂和lncRNAs与折射误差和近视有关,特别是在儿童时期.
• 这些非编码元素是了解近视的遗传基础的重要目标.
• 该研究为未来的功能研究提供了候选miRNA结合部位和增强剂的优先清单.