法国全国范围的土壤监测调查的微生物参数统一数据集
Aurélien Cottin1, Samuel Dequiedt1, Christophe Djemiel1
1Agroécologie, INRAE, Institut Agro, Univ. Bourgogne, Univ. Bourgogne Franche-Comté, F-21000, Dijon, France.
Scientific data
|January 8, 2025
概括
法国土壤监测数据显示,微生物多样性对生态系统服务至关重要. 这项研究协调并公布了以前无法获得的微生物学数据集,以加强土壤研究和长期质量评估.
科学领域:
- 土壤微生物学 土壤微生物学
- 生态生态学 生态生态学
- 环境科学环境科学
- 生物地理学 生物地理学 生物地理学
背景情况:
- 土壤提供了重要的生态系统服务,包括碳动态和营养循环,由微生物多样性 (细菌,古生物,真菌) 支.
- 法国土壤质量监测网络 (RMQS) 自2000年以来收集了大量数据,为大规模的土壤健康评估提供了潜力.
- 来自RMQS的微生物数据基本上无法访问,这阻碍了对土壤微生物生态学的全面分析.
研究的目的:
- 通过分子工具,在法国各地对土壤微生物群落进行表征.
- 从RMQS中协调和发布以前无法获得的微生物学数据集.
- 促进长期,大规模的土壤质量监测和土壤微生物生态学和生物地理学的研究.
主要方法:
- 从2000年至2015年的RMQS中分析了2,240个法国土壤地点.
- 应用分子技术,包括微生物生物质的DNA分析,细菌和真菌的定量PCR (qPCR),以及16S rDNA基因的高通量安普利康序列.
- 在Dataverse仓库中协调和发布原始微生物学结果.
主要成果:
- 对2,168个地点生成的分子微生物生物质数据.
- 对2,073个地点获得的细菌和真菌qPCR数据.
- 细菌和考古16S rDNA基因的高通量测序数据可用于1842个地点.
结论:
- 现在公开使用的RMQS微生物数据集,可以对土壤微生物生态和生物地理进行深入研究.
- 这些统一的数据对于理解微生物多样性与土壤生态系统服务之间的联系至关重要.
- 该数据集将通过真菌数据和持续的监测工作 (2016-2027) 更新,以确保持续的长期土壤健康评估.
