在使用NGS技术从阿根廷捕获的Aedes aegypti蚊子中检测到昆虫特异性RNA病毒
Lucas Ripoll1, Javier Iserte2, Carolina Susana Cerrudo1
1Laboratorio de Ingeniería Genética y Biología Celular y Molecular-Área de virus de insectos, Departamento de Ciencia y Tecnología, Universidad Nacional de Quilmes, Quilmes, Buenos Aires, Argentina.
PLoS neglected tropical diseases
|January 10, 2025
概括
研究人员使用纳米孔测序来检测阿根廷蚊子中的病毒. 这种方法识别了Humaita Tubiacanga病毒,Phasivirus和totivirus,有助于对 arbovirus 爆发的监测.
科学领域:
- 关节动物传播的病毒监测监测
- 下一代测序应用程序的下一代测序应用程序.
- 蚊子传播的疾病生态学
背景情况:
- 蚊子,特别是埃及蚊虫,传播重要的树木病毒,如登革热和寨卡病毒.
- 有效的树冠病毒监测对于预防疫情和制定控制策略至关重要.
- 在蚊子群体中表征循环病毒为疾病传播动态提供了关键的见解.
研究的目的:
- 实施和评估一种测序管道,用于在野外捕获的蚊子中检测树状病毒.
- 在阿根廷使用纳米孔技术识别和测序来自Aedes aegypti蚊子的病毒基因组.
- 评估这种方法对广泛病毒监测的有用性.
主要方法:
- 使用牛津纳米孔技术MiniON Mk1b进行快速测序.
- 采用了样本输入,样本输出 (SISPA) 方法进行病毒序列丰富.
- 分析了测序数据以识别和组装完整的病毒基因组.
- 从阿根廷的布宜诺斯艾利斯,圣达菲和萨尔塔省收集了蚊子样本.
主要成果:
- 成功测序了Humaita Tubiacanga病毒 (HTV),Phasi Charoen类Phasivirus (PCLV) 和Aedes aegypti totivirus (AaeTV) 的全基因组.
- 在阿根廷的不同地理区域检测到这些病毒.
- 证明了纳米孔测序与SISPA结合用于病毒发现的可行性.
结论:
- 纳米孔测序为蚊子中的树状病毒监测提供了一个强大的工具.
- 这种方法可以检测人类致病性和昆虫特异性病毒.
- 这种方法可以增强早期检测树虫病毒,并为公共卫生战略提供信息.
