对使用全基因组测序的猪生产系统中Streptococcus suis流行病学的新见解
Anna Vilaró1, Kasper T Karstensen2, Laia Serra1
1Grup de Sanejament Porcí (GSP), Partida Caparrella 97C, Lleida 25192, Spain.
Veterinary microbiology
|January 10, 2025
概括
在西班牙,使用全基因组测序研究了具有动物感染潜力的猪病原体Streptococcus suis. 血清型9和ST123是最常见的,检测到广泛的耐药基因,如tet(O) 和erm(B).
科学领域:
- 兽医微生物学 兽医微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 流行病学 流行病学
背景情况:
- 瑞士杆菌 (S. suis) 是一种重要的猪病原体,造成经济损失,并对人类构成动物感染风险.
- 了解S. suis的遗传多样性和抗菌素耐药性对于兽医和公共卫生管理至关重要.
研究的目的:
- 从西班牙猪中分离出S. suis的遗传特征,包括血清型,序列类型 (ST),以及抗菌素耐药性 (AMR) 和毒性基因.
- 调查S. suis在集成猪生产系统中的垂直传播模式.
主要方法:
- 全基因组测序 (WGS) 在2018年至2022年期间从临床猪样本中收集的154个S. suis分离物上进行.
- 分析包括识别血清型,ST,AMR基因和病毒性相关基因.
- 遗传学分析被用来探索传播途径和农场起源之间的关联.
主要成果:
- 血清型9主要与ST123相关,是发现的最常见的血清型.
- 观察到抗微生物耐药性基因 (tet(O) 和 erm(B) 的高患病率,分别对四环素和宏化物产生耐药性.
- 关键毒性基因 (EPF,MRP,SLY) 的变异性存在和对测试的抗微生物药物具有低至高的表型耐药性,对多西环素和三甲-硫甲醇具有高耐药性.
结论:
- 该研究提供了西班牙猪群中S. suis的关键流行病学数据,突出了9/ST123血清型作为主导血统.
- 了解样本的来源,例如祖母和母母母猪场,对于有效的疾病管理和抗菌药物管理至关重要.
- 通过WGS进行遗传表征对于追踪S. suis和在动物和公共卫生环境中告知控制策略至关重要.
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