在牛中分析全基因组甲基化模式 牛感染了Ostertagia ostertagi

科学领域:

• 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
• 动物科学动物科学
• 免疫学 免疫学 免疫学

背景情况:

• 基因甲基化 (DNAm) 是一个关键的表观遗传机制,调节基因表达和基因组印记.
• 胃肠道 (GI) 线虫感染对牲畜健康和生产力构成重大挑战.
• 在表观遗传层面上了解宿主对寄生虫感染的反应,对于改善动物健康策略至关重要.

研究的目的:

• 为了研究Ostertagia ostertagi感染对宿主DNA甲基化模式对牛的影响.
• 为了确定与线虫感染相关的组织特异性和共享的差异甲基化位置 (DMP) 和区域 (DMR).
• 探索DNA甲基化变化与受感染牛的免疫反应之间的关系.

主要方法:

• 荷尔斯坦牛被感染了Ostertagia ostertagi或作为对照.
• 用哺乳动物甲基化阵列对腹 fundus,pylorus,排水淋巴结和十二指肠组织进行了全表观基因组的分析.
• 分析集中在31107头牛CpG,跨5082个基因,以确定差异甲基化.

主要成果:

• 感染诱导出不同的,特定于组织的DNA甲基化模式.
• 总共有389个共享DMP和2770个组织特异DMP被确定,其中许多在与免疫相关的基因中,特别是在排水淋巴结和腹腔底部.
• 在所有样本组织中观察到差异甲基化区域 (DMR),在排水淋巴结和肺底中显著存在低甲基化,在胆核和十二指肠中存在高甲基化.

结论:

• 在牛中,DNA甲基化对宿主对肠道线虫感染的反应起着重要作用.
• 在免疫相关基因中发现的DMP和DMR表明DNAm参与调节宿主对寄生虫的免疫力.
• 这项研究提供了关于感染肠道线虫牛的表观遗传调节格局的见解,可能为未来的疾病管理策略提供信息.