转录组和蛋白组分析麻疹病毒A5L表达HEK293T细胞的转录组和蛋白组分析
Mingzhi Li1,2,3, Jiaqi Xiong1,2,3, Hao Zhou3
1Institute of Pathogenic Microorganism, Jiangxi Agricultural University, Nanchang 330000, China.
International journal of molecular sciences
|January 11, 2025
概括
病毒 (MPXV) A5L蛋白显著影响宿主细胞功能,包括细胞循环和翻译. 这项研究揭示了MPXV A5L和宿主核糖体蛋白之间的关键相互作用,为病毒复制机制提供了洞察力.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 麻疹病毒 (MPXV) 是一个重要的动物感染威胁在Orthopoxvirus属.
- 对于MPXV的临床表现和宿主细胞内的分子相互作用的了解有限.
研究的目的:
- 通过转录和蛋白质组方法研究宿主细胞对MPXV A5L蛋白的反应.
- 阐明MPXV A5L在病毒宿主相互作用和细胞过程中的作用.
主要方法:
- 高通量RNA测序 (RNA-seq) 用于分析表达MPXV A5L的HEK293T细胞中的基因表达变化.
- 液体染色学-并联质谱学 (LC-MS/MS) 识别与MPXV A5L相互作用的宿主蛋白质.
- 基因本体学 (GO) 和基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 途径分析.
主要成果:
- 在HEK293T细胞中,MPXV A5L表达改变了1473个基因 (911个上调,562个下调).
- 确定了与MPXV A5L相互作用的185种宿主蛋白质,主要是核糖体和细胞骨蛋白质.
- 转录组分析表明细胞周期,核糖体和DNA复制通路的调节.
结论:
- MPXV A5L在病毒内部化和组装中起着至关重要的作用.
- MPXV A5L蛋白显著影响宿主的翻译系统.
- 结合的转录组和蛋白组数据为MPXV主机相互作用提供了新的见解.
