优化算法的比较,用于渐变形状的自动化方法开发
Gerben B van Henten1, Jim Boelrijk2, Céline Kattenberg3
1Analytical Chemistry Group, Van 't Hoff Institute for Molecular Sciences, Science Park 904, the Netherlands; Centre for Analytical Sciences Amsterdam (CASA), Amsterdam, the Netherlands.
微分演化 (DE) 在液体染色学的干优化方面表现出色,而贝叶斯优化 (BO) 在基于搜索的方法中是最好的. 算法选择取决于样本复杂度和响应函数.
科学领域:
- 分析化学 分析化学
- 染色体学 染色体学 是一种染色学.
- 计算化学计算化学
背景情况:
- 优化算法对于渐变化液色谱 (LC) 方法的开发至关重要.
- 这些算法在样本复杂性和色谱响应函数 (CRF) 等各种因素中缺乏标准化的比较.
- 在不同的观察模式下 (在 silico 和基于搜索) 评估算法性能是必不可少的.
研究的目的:
- 为了比较六个优化算法的有效性 (贝叶斯优化,微分演化,遗传算法,CMA-ES,随机搜索,网格搜索) 用于梯度化LC方法的开发.
- 根据各种样本,CRF和梯度复杂性的数据和时间效率来评估算法性能.
- 在干燥 (在) 和湿 (基于搜索) 观察模式中评估算法.
主要方法:
- 他们比较了六种优化算法:贝叶斯优化 (BO),微分演化 (DE),遗传算法 (GA),共变矩阵适应演化策略 (CMA-ES),随机搜索和网格搜索.
- 评估使用了多线性保留模型框架.
- 算法在各种样本,CRF和梯度段中在干燥 (in silico) 和湿 (基于搜索) 观察模式下进行了评估.
主要成果:
- 差异演化 (DE) 证明了干燥优化的高数据和时间效率.
- 贝叶斯优化 (BO) 在数据效率方面表现出色,对于基于搜索的优化 (<200个代) 最有效,但由于计算扩展,对于干燥优化是不切实际的.
- 染色体反应函数 (CRF) 和样本复杂性显著影响了算法效率,突出了更好的基准样本的需要和理解CRF诱导的复杂性.
结论:
- 在梯度LC方法开发中,DE是干燥优化的竞争性选择.
- 对于数据效率高,基于搜索的优化,BO是非常有效的,但对于大规模的干燥优化不太适合.
- 优化算法的选择应考虑样本特征和CRF,以开发高效的方法.
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