针对性下一代测序的应用价值使用支气管支气管洗液样本在儿童社区获得的肺炎中
Shiyi He1, Weishi Xue1, Xiaoning Wu1
1Department of Clinical Laboratory, The Second Affiliated Hospital of Guangxi Medical University, Nanning, Guangxi, People's Republic of China.
概括
目标下一代测序 (tNGS) 有效地识别了儿童社区获得性肺炎 (CAP) 的各种病原体,超过了传统方法. 虽然非常敏感,但tNGS结果需要仔细解释,以区分病原体和殖民者.
科学领域:
- 儿童传染病 儿童传染病
- 分子诊断学 分子诊断学
- 微生物学 微生物学
背景情况:
- 准确的病原体鉴定对于治疗小儿社区获得性肺炎至关重要.
- 针对儿科CAP病原体的目标下一代测序 (tNGS) 的诊断性能尚未得到充分证实.
研究的目的:
- 评估tNGS在检测患有CAP的儿童中广泛的病原体的疗效.
- 为了比较tNGS性能与传统培养和多重定量聚合酶链反应 (qPCR) 方法.
主要方法:
- 来自216名患有CAP的儿童的支气管洗液 (BALF) 样本使用tNGS,培养和多重qPCR进行了分析.
- 评估了病原体检测率和方法之间的一致性.
主要成果:
- tNGS在208名儿童中发现了389种微生物菌株,包括细菌,病毒,真菌和Mycoplasma pneumoniae.
- 与培养相比,tNGS对细菌 (56.9%与8.3%) 和真菌 (13.0%与4.2%) 的检测率显著更高.
- 在tNGS和多重qPCR之间观察到高度一致 (89.4%99.1%),用于呼吸道病毒检测.
结论:
- tNGS在儿科 CAP 中提供快速和全面的病原体鉴定,超过了传统的培养敏感度.
- tNGS与多重qPCR用于病毒检测具有高度一致性.
- tNGS的高度敏感性需要谨慎的解释,以区分致病原体和非致病生物.
