DNA超级卷调节真核转录以基因导向依赖的方式

科学领域:

• 分子生物学分子生物学
• 遗传学 是一个遗传学.
• 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.

背景情况:

• 转录诱导的扭曲应力改变了DNA超级卷.
• 超级卷可以传播并影响DNA相关的蛋白质活性.
• 在一个基因位点的基因表达可以影响附近的转录事件.

研究的目的:

• 研究DNA超级卷对基因组修饰和邻近基因转录的影响.
• 确定拓聚合酶在调节C中DNA超卷和转录中的作用. 伊莱根斯 (elegans) 是一个词.

主要方法:

• I和II型拓酶的急性耗尽.
• 全球运行测序 (GRO-seq) 用于新生的转录.
• 染色体免疫沉降测序 (ChIP-seq) 用于RNA聚合酶II占用.
• 用于基因表达的RNA测序 (RNA-seq).
• 切割和标记测试用于基因素修饰.

主要成果:

• 拓糖酶枯竭导致全基因组转录变化,基因组修饰变化最小.
• 在C.I.C.中, elegans topoisomerase I对于转录延长至关重要,并且与topoisomerase II部分冗余.
• 负超卷促进转录不同的基因的转录.
• 阳性超可以抑制对汇聚性基因的转录.
• 拓酶枯竭同步表达不同的基因对,但破坏了融合的基因表达.

结论:

• 由转录产生的DNA超级卷,以取决于方向的方式影响邻近的基因转录.
• 负超卷化促进不同基因对的协调表达.
• 过度的阳性超级卷阻碍了转录,破坏了融合基因表达.