53个多复合向蛋白质组学试验的表征,用于癌症细胞系的验证研究
Constance A Sobsey1,2, Gerald Batist3,4, Christoph H Borchers1,2,5,6,7
1Segal Cancer Proteomics Centre, Lady Davis Institute for Medical Research, Jewish General Hospital and McGill University, Montreal, Quebec H3T 1E2, Canada.
Journal of proteome research
|January 13, 2025
概括
这项研究开发并验证了50种蛋白质的定量质谱分析,创建了一个新的蛋白质组学小组. 这些验证的测试精确测量蛋白质水平,有助于癌症生物标志物的发现和临床翻译.
科学领域:
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 生物标志物发现发现
- 质谱测量质量谱测量
背景情况:
- 美国国家癌症研究所的临床蛋白质组学瘤分析联盟 (CPTAC) 旨在为临床翻译标准化蛋白质组学试验.
- 之前的一项研究确定了一种与癌症药物反应相关的蛋白质组特征.
研究的目的:
- 应用CPTAC指导方针来表征定量质谱 (MS) 分析.
- 开发和验证多重反应监测 (MRM) 蛋白质组学小组,用于生物标志物验证.
主要方法:
- 开发并优化了53种的MRM-MS测定方法,使用合成和稳定同位素标记的内部标准 (SIS) .
- 在 UPLC 系统与三重四极质谱仪 (QQQ-MS) 结合上进行了特征分析.
主要成果:
- 大多数开发的测试都是适合目的的,精确且可重复地量化内源水平上的.
- 针对以前未在CPTAC数据库中存在的蛋白质,开发了28个测试.
- 建立了一个由50个向蛋白质组成的验证的多重组面板.
结论:
- 经过验证的MRM-MS试验符合CPTAC生物标志物验证标准.
- 这个公开的小组支持癌症,细胞应激,神经学,心脏学和新陈代谢的研究.
关键词:
临床蛋白质瘤分析联盟 (CPTAC)生物标志物验证 生物标志物验证适合目的的测试验证.内部标准 内部标准 内部标准质谱测量质谱测量质谱测量质谱测量质量测量质谱测量质量测量质量测量质量测量质量测量质量测量质量测量质量测量质量测量质量测量质量测量质量测量质量测量质量测量质量测量质量测量质量测量质量测量质量测量质量测量质量测量多重反应监测 (MRM) 的方法多重定量测量多重定量测量有针对性的蛋白质组学.翻译控制的翻译控制
