来自原发性免疫缺陷和免疫能力强的儿科患者的鼻和便样本中的SARS-CoV-2分泌和遗传演变
Haifa Khemiri1,2, Ilhem Ben Fraj3, Alessio Lorusso4
1Laboratory of Clinical Virology, WHO Regional Reference Laboratory for Poliomyelitis and Measles for in the Eastern Mediterranean Region, Institut Pasteur de Tunis, University of Tunis El Manar, 13 place Pasteur, BP74 1002 le Belvédère, Tunis, Tunisia. haifa.khemiri@pasteur.utm.tn.
Virology journal
|January 13, 2025
概括
初级免疫缺陷疾病 (PID) 会导致儿童长期排泄SARS-CoV-2. 抗体和综合性缺陷显示病毒分泌时间最长,突显了这些患者需要专业护理的需要.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 病毒学 病毒学
- 儿科 儿科 儿科
背景情况:
- 初级免疫缺陷疾病 (PID) 增加了严重的COVID-19和长期的SARS-CoV-2感染的风险.
- 这项研究比较了小儿PID患者的病毒分泌持续时间和基因演变,与免疫能力强 (IC) 儿童相比.
研究的目的:
- 为了研究小儿PID患者中SARS-CoV-2分泌的持续时间.
- 分析小儿PID患者中SARS-CoV-2的遗传演变.
- 为了比较PID和IC儿科患者之间的病毒分泌和演变.
主要方法:
- 收集了5名PID和10名IC儿童的鼻和便样本.
- 使用RT-qPCR进行RNA检测和全基因组测序 (NexSeq 1000).
- 分析数据使用nextflow/viralrecon,GraphPad Prism v10和BEAST软件进行植物动力学分析.
主要成果:
- 病毒RNA在IC儿童 (鼻) 中检测到长达14天,在PID患者中检测到长达28天.
- 患有PID的患者表现出长时间的排泄 (平均15天鼻,最多28天便).
- 在PID患者中发现的Delta (AY.122) 和Omicron (BA.1.1) 变种;特定的氨基酸变化 (A2821V,R550H) 已注明.
结论:
- 在PID患者中观察到长时间的SARS-CoV-2RNA分泌,特别是那些抗体和联合缺乏症患者.
- 一名PID患者出现并发症并死亡.
- 专门的护理对于管理COVID-19的PID患者至关重要.
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