FHIR PIT:一个地理空间和时空数据集成管道,以支持主体级临床研究

科学领域:

• 医疗信息学 医疗信息学
• 环境健康 环境健康
• 临床研究数据集成和整合.

背景情况:

• 电子健康记录 (EHR) 数据和调查数据对于临床研究至关重要.
• 将环境暴露 (如空气污染物) 与临床数据相结合,因数据格式和分辨率不一致而存在挑战.
• 现有的方法缺乏患者层面整合不同数据集的工具.

研究的目的:

• 开发一个开源软件管道,以整合患者级别的电子病历数据与环境暴露.
• 促进对环境因素对健康的影响的研究.

主要方法:

• 开发了FHIR PIT (HL7®快速医疗互操作性资源患者数据集成工具),这是一个开源的模块化软件管道.
• 集成的EHR数据 (FHIR格式) 与各种分辨率和格式的环境数据.
• 应用FHIR PIT对喘和初级状动力障碍群体,生成综合特征表.

主要成果:

• FHIR PIT成功地将患者的电子病历数据与环境暴露相结合.
• 综合数据的探索揭示了呼吸系统住院病例的增加,以及对颗粒物和臭氧的更高暴露.
• 患有原发性纤维动力障碍的患者的整体住院次比喘患者高.

结论:

• FHIR PIT v1.0促进了对环境暴露和健康结果的研究.
• 该工具支持对喘和初级状动力障碍的研究.
• 开源转换工具可用于将其他常见数据模型 (PCORnet,i2b2,OMOP) 映射到FHIR.