时间转录组在肉肉中对沙门氏菌 (Salmonella enterica serovar enteritidis) 感染的反应中进行分析
Yanan Peng1, Huilong Li1, Jingchao Yang2
1Shandong Provincial Key Laboratory for Livestock Germplasm Innovation Utilization, College of Animal Science and Technology, Shandong Agricultural University, Tai'an 271018 China.
Poultry science
|January 15, 2025
概括
在中感染沙门氏菌 (Salmonella Enteritidis) 引发了视的时间依赖的免疫和代谢反应. 感染后14天,从免疫反应转变为代谢适应.
科学领域:
- 兽医免疫学 兽医免疫学
- 分子生物学分子生物学
- 禽畜科学 禽畜科学 禽畜科学
背景情况:
- 沙门氏菌对家禽健康和人类食品安全构成重大威胁.
- 了解分子层面的宿主-病原体相互作用对于开发有效的控制策略至关重要.
- 肉是沙门氏菌殖民和宿主免疫反应的关键地点.
研究的目的:
- 为了研究在沙门氏菌感染后,肉肉转录组的时间变化.
- 确定参与宿主反应的关键免疫和代谢途径.
- 阐明感染期间免疫和新陈代谢之间的动态相互作用.
主要方法:
- 用RNA测序 (RNA-seq) 来分析感染后1,3,7和14天 (dpi) 的肉肉的基因表达特征.
- 差异基因表达分析发现了显著的基因表达变化.
- 基因本体学 (GO) 丰富和权重基因共同表达网络分析 (WGCNA) 用于识别关键途径和枢纽基因.
主要成果:
- 在所有时间点中都发现了大量的差异表达基因 (DEG),峰值为3和7dpi.
- 免疫相关途径 (例如,细胞因子-细胞因子受体相互作用,Toll类受体信号传递) 在3和7dpi时得到丰富.
- 代谢途径在14dpi时变得越来越突出,这表明宿主反应发生了变化.
- WGCNA确定了与能源,非编码过程,免疫力和发展相关的关键模块.
结论:
- 对沙门氏菌感染的 cecal 反应是时间依赖的,涉及免疫,新陈代谢和信号传导的协调调节.
- 感染后的第3天和第7天对于免疫反应至关重要.
- 到14dpi,转向代谢适应以控制感染,突出显示主体-病原体相互作用的动态.
