单细胞概况转录学揭示了乳腺癌淋巴结,骨和大脑转移中的细胞异质性和细胞交叉声

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 基因组学就是基因组学.
• 细胞生物学 细胞生物学

背景情况:

• 乳腺癌转移是导致死亡的主要原因.
• 了解原发性瘤和转移之间的单细胞差异至关重要.
• 目前关于乳腺癌转移在单细胞水平上的异质性的知识是有限的.

研究的目的:

• 在单细胞水平上分析原发性乳腺癌及其转移 (淋巴结,骨,大脑) 的微环境异质性.
• 识别不同的细胞亚群及其在转移中的作用.
• 研究细胞间通信和特定细胞类型,特别是癌症相关纤维细胞 (CAF) 的预后意义.

主要方法:

• 来自GEO数据库的单细胞RNA测序数据分析.
• 推断CNV算法用于恶性上皮细胞的表征.
• 蜂聊天 (CellChat) 是用于细胞间通信分析的软件包.
• 对生物功能进行基因组变异分析.
• 针对STMN1和CAF的免疫组织化学染色.

主要成果:

• 在初级和转移样本中发现了七个不同的细胞群.
• 淋巴结转移中T-NK和B细胞占主导地位;纤维细胞在脑转移和原发性瘤中很常见.
• 在所有转移部位中,增殖性癌症相关纤维细胞 (pCAFs) 的比例很高.
• 确定了四个恶性上皮细胞亚群 (G0-G3),其中G2表现出高侵袭性,并分化为增殖性G1/G3细胞.
• 细胞-细胞通信分析揭示了pCAFs和转移相关的恶性上皮细胞之间的相互作用.
• 增加的pCAF比例与晚期乳腺癌和不良预后相关.

结论:

• 单细胞转录组学提供了关于乳腺癌转移到淋巴结,大脑和骨的细胞驱动因素的见解.
• pCAFs在乳腺癌转移中发挥着重要作用,并与患者的不良结果有关.
• 向pCAF可能是晚期乳腺癌的治疗策略.