对小鼠和人类前列腺单细胞转录组的元分析揭示了在组织回归,再生和癌症中广泛的上皮质可塑性

科学领域:

• 基因组学和分子生物学
• 癌症研究 癌症研究
• 泌尿器科 泌尿器科 泌尿器科 泌尿器科

背景情况:

• 在恒常状态,瘤开始和进展期间的前列腺上皮细胞状态仍然不太清楚.
• 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 的进步为前列腺细胞可塑性和癌症提供了新的见解.

研究的目的:

• 用scRNA-seq.q.来描述前列腺上皮细胞状态的动态变化.
• 为了比较老鼠和人类前列腺组织的细胞种群,并确定跨物种的相似性.
• 在前列腺癌进展过程中通过将转录组数据与副本编号变异集成来阐明转录程序.

主要方法:

• 进行了从小鼠和人类前列腺组织中scRNA-seq数据集的元分析.
• 利用随机矩阵理论对数据集进行异化,并建立了参考细胞类型分类.
• 采用最佳运输来进行跨物种的转录基因比较和综合分析,并具有副本数变异.

主要成果:

• 确定了正常,回归和初级前列腺瘤上皮细胞之间的转录组相似性.
• 观察到小鼠前列腺上皮细胞在回归过程中转向近端周尿道 (PrU) 状态的安德罗基因依赖性可塑性.
• 在人类良性前列腺增生和前列腺癌中检测到转录程序的重新连接,其中副本数变异主要存在于光细胞和瘤细胞中异质雌激素受体 (AR) 信号.

结论:

• 细胞异质性和可塑性为前列腺癌的起源和治疗反应提供了翻译性的见解.
• 鉴定低AR瘤种群表明,在未经治疗的原发性瘤中,预先存在割抵抗和神经内分泌分化潜力.