通过TRACE进行元素成像和组织病理学综合联合注册,以加强组织截面的空间多模式分析
Yunrui Lu1,2, Serin Han1, Aruesha Srivastava3
1Department of Pathology and Laboratory Medicine, Dartmouth Health, Lebanon, NH 03766, United States.
Bioinformatics advances
|January 20, 2025
概括
TRACE是一个新的网络应用程序,帮助研究人员将元素地图与组织幻灯片进行比较. 该工具可以改进在特定组织区域中金属生物积累的分析,以获得更好的病理洞察力.
科学领域:
- 生物医学成像学 生物医学成像学
- 病理学 病理学 病理学
- 计算生物学是一种计算生物学.
背景情况:
- 元素成像为特定组织区域提供精确的金属生物积累概况.
- 将元素地图与组织学幻灯片 (血素和乙素 - H&E) 进行比较对于准确的空间分析至关重要,但具有挑战性.
- 现有的方法缺乏精简的集成,用于共同记录整个幻灯片图像 (WSI) 和基本数据.
研究的目的:
- 推出TRACE,一个交互式Web应用程序,用于无共注册WSI和元素地图.
- 增强在病理条件下组织区域和元素丰度的分析.
- 为了促进空间分析和元素数据在标注的组织结构之间的比较.
主要方法:
- 开发一个容器化的网络应用程序 (TRACE),用于交互式分析.
- 实时注释编辑和先进的统计工具的实施.
- 整合WSI共同注册,用于多模式空间数据分析.
主要成果:
- 通过TRACE,可以简化WSI和元素地图的共同注册.
- 该应用程序支持在特定组织区域内的元素丰度的详细分析.
- TRACE 便于在不同的注释结构中对元素分布进行比较.
结论:
- TRACE为元素生物积累的空间分析提供了一个强大的平台.
- 该工具增强了组织学和基本成像数据的整合.
- 通过精确比较组织中的元素丰度,TRACE支持全面的病理分析.
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