一只淘汰赛老鼠的EBF3增强器的生成和表征
Emily Cordova Hurtado1, Janine M Wotton2, Alexander Gulka3
1Department of Genetics, Washington University School of Medicine, St. Louis, MO 63110, USA.
bioRxiv : the preprint server for biology
|January 20, 2025
概括
这项研究创建了一个被删除的EBF3增强剂的小鼠模型,揭示了它在神经发育障碍中的作用. 删除会影响EBF3的表达,并导致小鼠的性别特异性行为和身体成分变化.
科学领域:
- 遗传学和基因组学 在
- 神经科学是一个神经科学.
- 发展生物学 发展生物学
背景情况:
- 基因组研究将蛋白质编码和非编码区域的变异与神经发育障碍联系起来.
- 与低位症,缺氧和发育迟缓综合征 (HADDS) 相关的EBF3基因存在过多的新型蛋白质编码变异.
- 之前的研究在神经发育障碍患者中发现了EBF3增强剂hs737的de novo变异,以及其删除的丰富.
研究的目的:
- 为了生成和表征一种新的小鼠模型,在保护的调节区域Rr169617中删除,人类EBF3增强剂的正方体hs737.
- 研究这种删除对EBF3表达和下游基因调节的分子后果.
- 评估表型结果,包括与小鼠Rr169617删除相关的行为和生理变化.
主要方法:
- 在Rr169617监管区域内生成了一条鼠标线,删除了1,160bp.
- 进行异质合体交叉并分析孟德尔比率以评估等位基的生存能力.
- 在野生型,异合体和同合体删除小鼠中的量化Ebf3表达水平.
- 在胚胎大脑区域进行了差异基因表达分析.
- 执行行为表型 (开放场,洞板,光/黑暗过渡) 和分析身体组成.
主要成果:
- 异合体交叉显示了删除等位基因的显著枯竭,偏离了孟德尔的预期.
- 同胞性删除 (Rr169617-/-) 鼠标表现出EBF3表达的20%减少,而异胞性鼠标显示出10%的减少.
- 差异基因表达分析揭示了组织蛋白基因和其他与大脑发育相关的基因的失调.
- 行为表型鉴定确定了同卵性雄性与雌性相比,在移动性,速度和光/黑暗偏好的性别特异性差异.
- 与野生类型的对照对象相比,雄性和雌性同卵性小鼠表现出改变的身体组成.
结论:
- 在Rr169617监管区域内的删除显著减少EBF3表达.
- 删除Rr169617的小鼠模型总结了与神经发育障碍相关的分子和表型方面.
- 现型结果包括性别特异的行为变化和身体成分变化,突出显示了这个非编码调节区域在大脑发育中的作用.
- 这种小鼠系是研究神经发育障碍和EBF3基因调节网络中的非编码变异的宝贵资源.


