为实施对抗微生物耐药性和其他与医疗保健相关的病原体进行测序的框架

科学领域:

• 传染性疾病 传染性疾病
• 基因组学就是基因组学.
• 公共卫生 公共卫生

背景情况:

• 抗菌素耐药性 (AMR) 构成了全球严重的健康威胁,导致医疗相关感染 (HAI).
• 抗生素耐药性病原体是HAI的主要原因,需要先进的检测和控制策略.
• 下一代测序 (NGS) 提供了一种强大的工具,可以提高对AMR的检测和理解.

研究的目的:

• 提出一个框架来实施NGS在HAI和抗菌素耐药性病原体的监测和控制.
• 确定NGS在感染预防和控制 (IPC) 中的应用的差距并确定优先事项.
• 讨论这个NGS框架的全球实施,重点关注低收入和中等收入国家 (LMICs).

主要方法:

• 召开了第3届日内瓦感染预防和控制智囊团,汇集专家讨论对HAI和AMR的NGS.
• 开发了一个全面的框架,用于在医疗机构实施病原体测序.
• 详细讨论了框架的组成部分,包括实验室质量,数据分析和数据共享.

主要成果:

• 关于对HAI病原体实施NGS的建议框架,特别是那些具有抗菌素耐药性机制的病原体.
• 框架的关键组成部分涉及湿实验室质量,序列数据质量,数据库和工具选择,生物信息学,数据共享和集成.
• 该框架旨在支持公共卫生倡议和IPC行动.

结论:

• 拟议的NGS框架为加强对抗菌素耐药性的监测和控制提供了路线图.
• 成功实施需要注意质量控制,数据管理和协作数据共享.
• 该框架是为全球适用而设计的,对资源有限的环境进行了具体考虑.