在409和415nm抗微生物蓝光处理下对定量基因表达分析的参考基因的识别和验证
Beata Kruszewska-Naczk1, Mariusz Grinholc1, Aleksandra Rapacka-Zdonczyk1
1Laboratory of Photobiology and Molecular Diagnostics, Intercollegiate Faculty of Biotechnology, University of Gdansk and Medical University of Gdansk, Gdańsk, Poland.
Frontiers in molecular biosciences
|January 21, 2025
概括
大肠杆菌中的集成宿主因子β子单元 (ihfB) 基因是抗菌蓝光 (aBL) 治疗中最稳定的参考基因. 这一发现对于在aBL条件下进行准确的基因表达研究至关重要.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 分子生物学分子生物学
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 定量实时聚合酶链反应 (qPCR) 对于基因表达分析至关重要.
- 精确的基因表达研究需要使用稳定表达的参考基因.
- 关于适合用于抗微生物光动力失活 (aPDI) 和抗微生物蓝光 (aBL) 治疗的参考基因的数据有限.
研究的目的:
- 为了确定在亚致命条件下抗微生物蓝光 (aBL) 治疗最稳定的参考基因.
- 评估aBL治疗后与未经治疗的对照组相比,基因表达的差异.
主要方法:
- 通过使用BestKeeper,geNorm,NormFinder和RefFinder算法评估参考基因稳定性.
- 在409nm和415nm aBL辐射下测试的基因稳定性在*Escherichia coli*中.
主要成果:
- 在409nm和415nm的aBL治疗后,ihfB基因 (集成宿主因子β子单元) 显示出最稳定的表达.
- RefFinder,geNorm和NormFinder确定了*ihfB*作为排名第一的稳定参考基因.
- *cysG*和*gyrA*的组合也被NormFinder确定为稳定.
结论:
- *ihfB*基因是抗微生物蓝光 (aBL) 压力下的*Escherichia coli*的可靠参考基因.
- 参考基因验证对于特定的压力因素至关重要,例如不同波长的aBL.
- 这项研究为aBL研究提供了必要的基因参考数据.
关键词:
最好的保姆是最好的保姆埃舍里希亚大肠杆菌 (Escherichia coli) 是一个大肠杆菌.规范寻找器 (NormFinder) 是一个寻找规范的工具.RT-qPCRR 是一个人.在RefFinder中找到.抗微生物蓝光是一种抗微生物蓝光.在GeNorm上使用.基因参考基因是指基因的参考基因.更多相关视频
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