人工智能和机器学习在基于无细胞DNA的诊断中
W H Adrian Tsui1,2,3, Spencer C Ding1,2,3, Peiyong Jiang1,2,3,4
1Center for Novostics, Hong Kong Science Park, Pak Shek Kok, New Territories, Hong Kong SAR, China.
Genome research
|January 22, 2025
概括
人工智能 (AI) 和机器学习 (ML) 正通过分析无细胞DNA (cfDNA) 碎片化模式来彻底改变液体活检. 这些技术增强了产前检测和癌症检测的非侵入性诊断.
科学领域:
- 基因组学和生物信息学
- 计算生物学 计算生物学
- 分子诊断学 分子诊断
背景情况:
- 血中循环的无细胞DNA (cfDNA) 提供了对胎儿动脉,癌症检测和移植监测的非侵入性诊断潜力.
- 高通量测序能够对cfDNA特征进行详细分析,产生许多跨遗传学,表观遗传学,转录组学和片段组学的生物标志物.
- 机器学习 (ML) 和人工智能 (AI) 擅长整合高维数据,使它们适合推进液体活检应用.
研究的目的:
- 审查和突出应用到基于cfDNA的诊断的各种AI和ML方法.
- 讨论ML / AI与cfDNA分析的整合,用于非侵入性产前检测和癌症液体活检.
- 探索利用cfDNA碎片化模式的未来方向,使用ML/AI在甲基组和转录研究中.
主要方法:
- 介绍cfDNA的生物学和ML和AI技术的基本概念.
- 讨论在cfDNA诊断中基于ML/AI的选择性应用,包括非侵入性产前检测和癌症液体活检.
- 对特定应用的分析,如胎儿DNA分数减去,血DNA组织映射和癌症检测/局部化.
主要成果:
- 人工智能和机器学习有效地分析cfDNA特征,提高了非侵入性诊断测试的精度.
- 展示的应用包括精确的胎儿DNA分数测定和通过液体活检改善癌症检测和局部化.
- 与ML/AI相结合的cfDNA碎片组学,显示出未来在表观遗传学和转录组学方面的诊断进步的前景.
结论:
- 人工智能和机器学习是推动基于cfDNA的液体活检的强大工具,为非侵入性诊断提供了显著的改进.
- ML/AI与cfDNA分析的整合为早期疾病检测,风险评估和个性化医疗提供了巨大的潜力.
- 未来的研究应该专注于进一步开发ML / AI算法,以充分利用cfDNA碎片化模式,以获得全面的诊断见解.
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