下一代元基因组测序用于临床识别脊髓感染相关的病原体
Tengfei Shi1, Yuhan Lin2, Xuexin Zheng1
1Department of Clinical Laboratory, Fuzhou Second General Hospital, Fuzhou, Fujian, China.
Frontiers in cellular and infection microbiology
|January 23, 2025
概括
甲基因组下一代测序 (mNGS) 为诊断脊柱感染 (SI) 提供了高灵敏度,可以检测传统方法错过的各种病原体. 将mNGS与成像和实验室测试相结合,可以提高诊断准确度,以获得有效的治疗.
科学领域:
- 传染性疾病 传染性疾病
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 医学诊断 医学诊断 医学诊断
背景情况:
- 脊柱感染 (SI) 由于多种不同的致病原体,存在复杂的诊断挑战.
- 传统的诊断方法,如微生物培养,对SI的敏感性和病原体覆盖有局限性.
研究的目的:
- 评估元基因组下一代测序 (mNGS) 在脊髓感染 (SI) 中识别病原体的有效性.
- 将mNGS的诊断性能与SI的传统实验室和成像技术进行比较.
主要方法:
- 从193名疑似SI.患者的临床数据的回顾性分析.
- 将mNGS诊断性能与组织病理学,微生物培养,实验室测试 (ESR,CRP) 和成像 (MRI,CT) 的比较.
- 基于样本类型 (活检与外科手术) 和先前使用抗生素的mNGS检测率的分析.
主要成果:
- mNGS在77.78%的SI病例中检测到病原体,识别出包括常见和罕见病原体在内的多种生物,并检测出文化遗漏的感染.
- 与微生物培养 (27.16%) 相比,mNGS在SI诊断方面表现出显著更高的灵敏度 (77.78%),具有可比的特异性.
- 虽然成像和炎症标志物显示出更高的灵敏度,但它们的特异性很低;mNGS没有显示以前使用抗生素或样本类型的显著影响.
结论:
- mNGS是脊髓感染的高度敏感和全面的诊断工具,能够识别广泛的病原体.
- 将mNGS与成像和实验室指标集成,可以大大提高SI诊断的准确性.
- mNGS为指导脊柱感染管理中的临床治疗决策提供了至关重要的支持.
