通过全基因组测序检测具有在ARSB中断点的逆转,导致MPS VI:经验教训和最佳实践
Yufeng Huang1, Wenyue Deng2, Hui Huang1
1Genetics and Precision Medical Center, Wuhan Children's Hospital (Wuhan Maternal and Child Healthcare Hospital), Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan, China.
Frontiers in genetics
|January 23, 2025
概括
全基因组测序 (WGS) 对于在全外基因组测序 (WES) 失败时诊断VI型粘多糖症 (MPSVI) 至关重要. WGS可以识别复杂的基因变异,例如颠倒破坏ARSB基因的逆转,这对于准确的分子诊断至关重要.
科学领域:
- 遗传学 是一个遗传学.
- 分子生物学分子生物学
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 粘多糖症VI型 (MPSVI) 是一种自体逆性溶酶体储存障碍.
- 在ARSB基因的致病变体导致MPSVI.
- 整体外基因组测序 (WES) 通常可以识别致病变体.
研究的目的:
- 为了调查MPSVI在一个怀疑诊断的中国家庭的遗传基础.
- 评估全基因组测序 (WGS) 的实用性,当WES不足以进行分子诊断时.
- 识别复杂的遗传变异,包括深层内在变异和结构重组.
主要方法:
- 进行了全外体测序 (WES) 和全基因组测序 (WGS).
- 对酸硫酸酶B活性进行了溶解体酶测定.
- 桑格测序和卡里奥类型被用于变体验证.
主要成果:
- 在ARSB基因中,WES发现了一个单一的误解变异.
- WGS揭示了一种偏心逆转,破坏了探测器及其父亲中的ARSB基因.
- 逆转得到了卡里奥类型和断点验证的证实.
结论:
- WGS对于分子诊断至关重要,因为WES对于MPSVI.
- WGS对于检测结构变异和深层内基突变至关重要.
- 这一案例凸显了WGS在临床上高度怀疑遗传疾病的患者中的重要性.
