使用VNtyper诊断的ADTKD-MUC1的表型异质性,这是一种新的遗传技术

科学领域:

• 遗传学和分子生物学
• 腎臟病學 (nephrology) 是一種醫學專業.
• 生物信息学是一种生物信息学.

背景情况:

• 由于MUC1基因变异导致的自体主导管间性病 (ADTKD) 的分子诊断是具有挑战性的,因为变异位于可变数量的并列重复 (VNTR) 区域.
• 标准的短读测序技术不足以识别这些MUC1 VNTR致病变体.
• 以前开发的计算管道 VNtyper 旨在从短读序列中可靠检测 MUC1 VNTR 变体.

研究的目的:

• 在患有脏疾病的患者中报告ADTKD-MUC1的意外诊断,使用VNtyper计算管道提交基因测试.
• 评估VNtyper在识别MUC1变异中对各种脏疾病患者的不同队列的有用性.

主要方法:

• 进行了一项横截面观察性研究,涉及2017年至2023年间4040名转诊进行基因检测的患者.
• 患者被转诊进行基因检测,以检测其是否患有球体疾病,纤毛病,脏和尿路的先天性异常 (CAKUT),ADTKD或来源不明的慢性脏疾病 (CKD).
• 应用了VNtyper管道来检测MUC1变异在以前没有测试MUC1的患者.

主要成果:

• VNtyper确定了40名患有MUC1变异的患者,其中包括33名新指数患者和7名亲属.
• 在没有临床怀疑ADTKD的患者中,检测到的MUC1变异率为0.05% (淋巴细胞疾病),1.2% (乳房病变),0.09% (CAKUT) 和2.5% (来源不明的CKD).
• 在6名患者中没有病家族病史,在2名患者中证实了新的ADTKD-MUC1.

结论:

• VNtyper计算管道使得在具有不同病表型的大群患者中诊断ADTKD-MUC1成为可能.
• 该研究在没有临床怀疑的患者中确定了ADTKD-MUC1,突出显示了该工具的诊断实用性.
• 这些发现表明,ADTKD-MUC1可以呈现异常表型,有时是由于同时进行的遗传诊断或新突变.