用双人内源性逆转录病毒进行分层系统,用于预测转移性清细胞癌中免疫治疗的疗效
Xiaofan Lu1, Yann-Alexandre Vano2,3, Xiaoping Su4
1Department of Cancer and Functional Genomics, Institute of Genetics and Molecular and Cellular Biology (IGBMC), CNRS/INSERM/UNISTRA, Illkirch-Graffenstaden, France.
Journal for immunotherapy of cancer
|January 23, 2025
概括
一种新的双内源逆转录病毒 (ERV) 风险模型预测了转移性清细胞脏细胞癌 (ccRCC) 免疫检查点抑制剂 (ICI) 反应. 这种ERV分层系统改进了精密瘤学的现有模型.
科学领域:
- 基因组学和瘤学
- 免疫疗法研究 免疫疗法研究
- 癌症生物标志物 癌症生物标志物
背景情况:
- 内源逆转录病毒 (ERV) 是人类基因组中古老感染的遗留物.
- ERV失调与癌症中的免疫透有关,但其在转移性清细胞癌 (ccRCC) 免疫检查点抑制剂 (ICI) 反应中的作用尚不清楚.
研究的目的:
- 调查ERV表达和ICI治疗结果在转移性ccRCC中的相关性.
- 开发基于ERV表达的ICI响应的新型预测模型.
主要方法:
- 在两项临床试验 (nivolumab和ipilimumab-nivolumab) 中,分析了229名转移性ccRCC患者的RNA测序数据.
- 使用ERVmap算法对ERV表达式进行量化.
- 统变的考克斯回归和引导方法来评估666个ERV的预后意义.
主要成果:
- 两个ERV,E4421_chr17和E1659_chr4,显示出相反的预后影响.
- 开发了一个基于ERV的三层风险模型,与ICI治疗结果有显著的相关性.
- 该模型的性能优于传统的转录基因签名,并使用组合的DNA甲基化数据进行了改进.
结论:
- 基于ERV的双层分层系统有效预测ICI治疗的ccRCC患者的风险和临床结果.
- 该系统提高了预测精度,并支持瘤学的个性化医疗方法.


