基因与环境的相互作用:非黑色素瘤皮肤癌 (NMSC) 中的小删除 (DEL) 和转录基因特征以及对治疗的潜在影响

科学领域:

• 基因组学就是基因组学.
• 环境健康 环境健康
• 皮肤病学 皮肤病学

背景情况:

• (As) 是已知的非黑色素瘤皮肤癌 (NMSC) 的风险因素. 之前的研究探讨了单核酸变异和基因表达在As暴露的个体.
• 了解NMSC的基因组变化,特别是与等环境暴露有关的基因组变化,对于开发有效的预防和治疗策略至关重要.

研究的目的:

• 调查小删除 (DEL) 和转录组资料与非黑色素瘤皮肤癌 (NMSC) 之间的关联,在暴露于的个体中.
• 为了确定体质DELs,暴露和NMSC中的基因通路失调之间的相互作用.
• 基于这些分子发现,探索潜在的治疗点.

主要方法:

• 对NMSC瘤组织 (n=32) 和配对的血液样本进行比较分析.
• 从单独的队列中分析健康的皮肤和配对的血液样本 (n=16).
• 识别与NMSC相关的小删除 (DEL).
• 转录形状分析以评估关键通路 (例如TGF-β,IL-17,PD-L1) 中的差异性基因表达.
• 检查DELs,暴露水平和基因通路表达之间的相互作用.

主要成果:

• 确定了与NMSC相关的小删除 (DEL),其中许多位于短串重复 (STR) 区域.
• 包括TGF-β,IL-17和PD-L1在内的途径中的差异性基因表达与体质DEL和暴露有显著的相互作用.
• 在低的病例中,APC DEL与炎症T细胞基因增加了8.9倍;在高的病例中,APC DEL增加了5.8倍.

结论:

• 这项研究是第一个报告NMSC组织体质DEL,暴露和失调的基因通路之间的显著关联的研究.
• 这些发现强调了NMSC发育中的遗传变化和环境因素之间的相互作用.
• 这些见解可能会为针对性治疗的患者分层提供信息,包括PD-L1,IL-17和TGF-β抑制剂.