综合转录组和向代谢分析揭示了涉及光生物合成的关键基因
Xiaolan Xu1, Chunxia Li1, Fangjing Wu1
1College of Bee Science and Biomedicine, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China.
Journal of fungi (Basel, Switzerland)
|January 24, 2025
概括
这项研究通过分析不同生长阶段的代谢物和基因表达来研究Ganoderma lucidum中皮虫三类 (GT) 的生物合成. 确定了参与GT积累的关键基因,为其复杂的途径提供了洞察力.
科学领域:
- 菌学和真菌生物技术 菌学和真菌生物技术
- 代谢学和转录学.
- 自然产品生物合成 自然产品生物合成
背景情况:
- 甘菌 (Ganoderma lucidum) 是一种药用真菌,以生物活性甘菌三类 (GTs) 闻名.
- GTs的药理作用包括抗瘤,抗氧化和免疫调节性质.
- GTs的生物合成途径和积累机制在很大程度上仍然未被描述.
研究的目的:
- 为了确定参与Ganoderma lucidum中GTs生物合成途径的基因.
- 在真菌发育过程中分析差异化代谢物和基因表达模式.
- 为了理解GT积累,将代谢变化与基因表达相关联.
主要方法:
- 针对G. lucidum在不同的生长阶段进行了向的代谢和转录分析 (primordia,成熟的果实体,后子果实体).
- 差异性代谢物分析侧重于三类化合物和其他化合物.
- 差异基因表达分析确定了生长阶段之间的显著基因表达变化.
主要成果:
- 总共有112种三类型被检测到,在生长阶段之间,三代谢产物发生显著变化.
- 转录学揭示了成长阶段之间成千上万的差异表达基因 (DEGs).
- 相关性分析确定了六个转录因子 (TF) 和两个CYP450与四个三类成分显著相关.
结论:
- 关键基因,包括特定的TFs和CYP450s,与G. lucidum的GT生物合成有显著的关联.
- 这项研究为了解GT积累提供了有价值的遗传信息.
- 黄酸的存在表明,有可能对工程G. lucidum进行黄酸合成.
