双RNA-seq揭示了Fusarium virguliforme-Trichoderma afroharzianum相互作用期间的转录组变化

科学领域:

• 菌类学 菌类学是指菌类学.
• 植物病理学 植物病理学
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 三皮菌 spp. 三皮菌 它们是重要的生物控制剂,但它们的病原体识别机制和物种内部变异性需要进一步研究.
• 了解这些相互作用是优化生物控制程序的关键.
• 在病原体对抗期间,Trichoderma afroharzianum (T. afroharzianum) 隔离物体的表型差异已得到充分记录,但不太了解.

研究的目的:

• 在与Fusarium virguliforme (F. virguliforme) 相互作用时,研究两种T. afroharzianum分离物 (Th19A和Th4) 之间的转录组差异.
• 阐明生物控制有效性观察到的表型变异背后的分子机制.
• 识别病原体识别途径,包括潜在的挥发性介导信号.

主要方法:

• 使用双板测试来比较T. afroharzianum分离物对F. virguliforme的对抗活性.
• 进行了RNA测序,以分析不同相互作用阶段的F. virguliforme和T. afroharzianum的转录组.
• 用基因本体学 (GO) 丰富分析来识别差异表达的基因和途径.

主要成果:

• Th19A超越了F. virguliforme,而Th4则表现出抑制区,表明了不同的相互作用结果.
• 在与Th19A相比Th4相互作用时,在F. virguliforme中观察到显著的转录组差异,并在不同的时间点中观察到.
• F. virguliforme和T. afroharzianum都表现出显著的转录组变化,在分离物和相互作用阶段之间具有明显的GO丰富类别.
• 包括碳水化合物活性酶 (CAZymes) 和CBM1-域蛋白质在内的分泌蛋白质的升级在T. afroharzianum两种分离物中甚至在物理接触之前都被观察到,这表明挥发性介导的识别.

结论:

• 这项研究揭示了F. virguliforme和T. afroharzianum在相互作用期间显著的转录性塑性.
• 不同的基因表达,特别是分泌的蛋白质,表明复杂的识别机制,包括挥发性信号.
• 这些发现对于开发使用特定Trichoderma分离物更有效和更有针对性的生物控制策略至关重要.