由免疫受体分析和多克隆反应者的单细胞RNA表达指导的TCR转基因克隆选择
Nincy Debeuf1,2, Sahine Lameire1,2, Manon Vanheerswynghels1,2
1Laboratory of Immunoregulation and Mucosal Immunology, VIB Center for Inflammation Research, Ghent, Belgium.
eLife
|January 24, 2025
概括
由于前体频率低,研究T细胞激活是很困难的. 研究人员开发了一种使用单细胞测序和DALI软件的新方法,快速生成针对SARS-CoV-2尖端蛋白特异的CORSET8转基因小鼠.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 分子生物学分子生物学
- 病毒学 病毒学
背景情况:
- 调查早期的T细胞激活是具有挑战性的,因为天真T细胞的频率很低.
- 现有的产生T细胞受体 (TCR) 转基因小鼠的方法是劳动密集型的,对于新的病原体来说并不理想.
- 转基因TCR小鼠对于研究抗原特异性T细胞反应至关重要.
研究的目的:
- 开发一种快速有效的方法来产生抗原特异性T细胞受体 (TCR) 转基因小鼠.
- 创建一个转基因小鼠模型 (CORSET8),用于研究CD8 T细胞对SARS-CoV-2尖端蛋白的反应.
- 为了利用单细胞测序和目录分析来进行TCR选择.
主要方法:
- 利用单细胞测序和TCR谱分析来确定理想的T细胞克隆.
- 开发并实施了DALI软件,用于基于抗原反应性,增殖和免疫表型的快速TCR选择.
- 通过将选定的TCR序列插入表达向量,生成了CORSET8转基因小鼠.
主要成果:
- 成功生成了具有针对SARS-CoV-2尖端蛋白特异性TCR的CORSET8小鼠.
- CORSET8 T细胞在免疫接种,mRNA疫苗接种或SARS-CoV-2感染后表现出强烈的增殖和激活标记.
- 证明了结合TCR谱系分析与单细胞RNA测序 (scRNA) 免疫型化以快速选择TCR的有效性.
结论:
- 结合TCR谱系分析和scRNA免疫类型的新方法,可以快速选择抗原特异性TCR序列.
- 这种方法有助于有效地生成TCR转基因小鼠,对新出现的传染病特别有价值.
- CORSET8小鼠模型为研究SARS-CoV-2特异性CD8 T细胞免疫提供了有价值的工具.
