在健康的庇护犬中检测病原体和抗体分析,使用全元基因组测序
Smriti Shringi1, Devendra H Shah1, Kimberly Carney2
1School of Veterinary Medicine, Texas Tech University, Amarillo, TX 79106, USA.
Pathogens (Basel, Switzerland)
|January 25, 2025
概括
健康的庇护所狗携带各种动物传染病原体和抗生素耐药性基因 (ARG). 全基因组测序 (WMS) 确定了这些风险,突出了对人类的潜在传播,并为控制策略提供了信息.
科学领域:
- 兽医微生物学 兽医微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 庇护犬占美国物收养的很大一部分.
- 这些动物可以成为各种病原体的储存库,包括那些具有抗生素耐药性基因 (ARG) 的动物.
- 抗菌素耐药性 (AMR) 对动物和人类健康构成越来越大的威胁.
研究的目的:
- 通过使用全元基因组测序 (WMS) 对微生物病原体进行健康的庇护所狗的查.
- 评估该人群中的抗药性基因 (ARG),包括抗生素耐药性基因.
- 评估来自庇护所狗的AMR传播潜力.
主要方法:
- 整个元基因组测序 (WMS) 被应用于来自三个州58只健康的庇护所狗的便样本.
- 生物信息学分析用于识别微生物病原体和ARG.
- 基因组DNA被提取并分析,以表征微生物群落和耐药性.
主要成果:
- 在WMS中检测到53种潜在的动物传染病原体,包括细菌,原生动物,酵母,菌和病毒.
- 总共有4560个ARG签名,代表14个抗生素类的182个独特基因.
- 几乎一半的检测到的细菌病原体携带了ARG,四环素耐药性基因是最丰富的,而β-乳酸盐耐药性基因显示出最高的多样性.
结论:
- 健康的庇护所狗有各种动物传染病原体和ARG,这表明传染的风险.
- 在动物群体中,WMS是检测病原体和AMR监测的宝贵工具.
- 调查结果强调,需要制定策略,以减轻病原体和AMR在庇护环境和公众中的传播.
